More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0062 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0062  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
295 aa  599  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2837  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.68 
 
 
256 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2523  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.09 
 
 
256 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2869  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.14 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0905  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.77 
 
 
267 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1189  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.07 
 
 
258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1116  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.52 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.116 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.74 
 
 
256 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.79 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase, putative  37.33 
 
 
259 aa  119  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000620053  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.32 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0984  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.7 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.15 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000370596  hitchhiker  0.000000000404856 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.79 
 
 
357 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.411442  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0486  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.2 
 
 
261 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.08 
 
 
360 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1865  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.8 
 
 
253 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.827419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.5 
 
 
257 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.27 
 
 
266 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.86 
 
 
266 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1732  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.5 
 
 
270 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0855  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.21 
 
 
279 aa  106  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.99 
 
 
265 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.82 
 
 
297 aa  105  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.337573  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0951  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.91 
 
 
276 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1279  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.61 
 
 
250 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.13 
 
 
270 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.89 
 
 
275 aa  103  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1192  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.02 
 
 
279 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1165  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.02 
 
 
279 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2716  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.45 
 
 
251 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613339  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0904  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.36 
 
 
293 aa  102  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.27 
 
 
267 aa  102  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4345  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.45 
 
 
285 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0909  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.57 
 
 
292 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.173456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.52 
 
 
262 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1967  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.55 
 
 
282 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.394112  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.72 
 
 
267 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01870  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.83 
 
 
257 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.65 
 
 
301 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1408  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.38 
 
 
289 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.997076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.11 
 
 
266 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.38 
 
 
248 aa  99.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.74 
 
 
301 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0966  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.98 
 
 
260 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00202083  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.46 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0767  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.31 
 
 
267 aa  99  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0323676  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0857  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.98 
 
 
260 aa  98.2  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0923  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.89 
 
 
249 aa  98.2  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.532012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0349  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.51 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0785  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.24 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.577083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.24 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4840  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.61 
 
 
270 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2585  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.67 
 
 
293 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.221457  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04650  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.21 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0706142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.58 
 
 
301 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1391  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.48 
 
 
284 aa  96.3  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171853  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5266  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.04 
 
 
270 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.18 
 
 
270 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.54 
 
 
273 aa  95.9  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  25.28 
 
 
271 aa  95.5  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4955  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.09 
 
 
270 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5281  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.61 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5011  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.61 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4855  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.61 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.64 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0795  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.37 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.143713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5247  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.61 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5391  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.61 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.13 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1308  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.52 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.61 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.75 
 
 
268 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.76 
 
 
270 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2010  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.78 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1349  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.14 
 
 
282 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04851  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.37 
 
 
297 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.13 
 
 
261 aa  94  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.3 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.17 
 
 
261 aa  93.6  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_839  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.69 
 
 
260 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00921901  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1235  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.24 
 
 
269 aa  93.2  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.38 
 
 
269 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.29 
 
 
271 aa  92.8  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0790  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.8 
 
 
293 aa  92.4  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0767  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.8 
 
 
293 aa  92.4  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2305  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.08 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.537495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.7 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0393  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.9 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000685519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3817  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.67 
 
 
305 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311868  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1342  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.97 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0703  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.59 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.609213 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0431  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.94 
 
 
271 aa  90.9  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.40782  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05161  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.33 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.35 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.83 
 
 
263 aa  90.1  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0760049  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0737  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.2 
 
 
257 aa  89.7  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.76 
 
 
268 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  26.76 
 
 
268 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0417  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.57 
 
 
276 aa  89.7  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>