234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0005 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0005  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 		 400 aa  823    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  39.55 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  39.09 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  39.14 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  39.14 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  38.94 
 
 		 401 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  39 
 
 		 401 aa  286  5.999999999999999e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  38.07 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  37.63 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  39.04 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  38.13 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  37.06 
 
 		 397 aa  282  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2280  aromatic amino acid aminotransferase  36 
 
 		 405 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  37.06 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1447  aromatic amino acid aminotransferase  40 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  39.48 
 
 		 396 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0911  aromatic amino acid aminotransferase  39.19 
 
 		 411 aa  280  5e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3590  aromatic amino acid aminotransferase  37.06 
 
 		 398 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2182  aromatic amino acid aminotransferase  37.06 
 
 		 398 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  36.55 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000156913  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1031  aromatic amino acid aminotransferase  39.22 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643394  hitchhiker  0.0066077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2326  aromatic amino acid aminotransferase  37.06 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.88203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  36.55 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  39.22 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  39.22 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  36.8 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  39.22 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1976  aromatic amino acid aminotransferase  37.56 
 
 		 396 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0721225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3404  aromatic amino acid aminotransferase  36.92 
 
 		 401 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297741 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  36.55 
 
 		 397 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  38.38 
 
 		 398 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4233  aromatic amino acid aminotransferase  37.56 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1999  aromatic amino acid aminotransferase  36.8 
 
 		 397 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2805  aromatic amino acid aminotransferase  37.06 
 
 		 398 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  36.04 
 
 		 397 aa  275  9e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00932  aspartate aminotransferase, PLP-dependent  38.96 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2715  Aspartate transaminase  38.96 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0131246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00939  hypothetical protein  38.96 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00958049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1027  aromatic amino acid aminotransferase  38.96 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212839  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2192  aromatic amino acid aminotransferase  38.96 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.330977 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4017  aromatic amino acid aminotransferase  37.31 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  36.04 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1036  aromatic amino acid aminotransferase  38.96 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4350  aromatic amino acid aminotransferase  37.31 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461114  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2668  aromatic amino acid aminotransferase  38.96 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0040813  normal  0.145428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2390  aromatic amino acid aminotransferase  38.96 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4898  aromatic amino acid aminotransferase  35.52 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6004  aromatic amino acid aminotransferase  37.06 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.443783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1687  aromatic amino acid aminotransferase  37.72 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.262918  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3759  aromatic amino acid aminotransferase  37.31 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  36.29 
 
 		 397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  36.29 
 
 		 397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3642  aromatic amino acid aminotransferase  36.55 
 
 		 397 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.463621  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003143  aspartate aminotransferase  37.15 
 
 		 396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0258  aromatic amino acid aminotransferase  36.55 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1089  aromatic amino acid aminotransferase  38.7 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  37.47 
 
 		 396 aa  272  7e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1670  aromatic amino acid aminotransferase  37.06 
 
 		 400 aa  272  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0668347  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0838  aromatic amino acid aminotransferase  38.32 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5339  aromatic-amino-acid aminotransferase  35.34 
 
 		 399 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  36.62 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01890  aromatic amino acid aminotransferase  37.91 
 
 		 399 aa  270  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  37.22 
 
 		 400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  35.53 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1593  aromatic amino acid aminotransferase  36.6 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3504  aromatic amino acid aminotransferase  36.29 
 
 		 397 aa  270  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4268  aromatic amino acid aminotransferase  36.8 
 
 		 400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0463663  normal  0.625536 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0702  aromatic amino acid aminotransferase  35.28 
 
 		 397 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1729  aromatic amino acid aminotransferase  38.44 
 
 		 401 aa  269  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0015695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  38.38 
 
 		 398 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  35.88 
 
 		 397 aa  269  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1538  aromatic amino acid aminotransferase  38.89 
 
 		 398 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  38.38 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  37.72 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  35.62 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  36.62 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  38.64 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5444  aromatic amino acid aminotransferase  37.28 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0293497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1664  aromatic amino acid aminotransferase  38.7 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233263  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1762  aromatic amino acid aminotransferase  36.08 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0667  aromatic amino acid aminotransferase  36.08 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.588804  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2395  aromatic amino acid aminotransferase  36.08 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.441327  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0798  aromatic amino acid aminotransferase  36.08 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1187  aromatic amino acid aminotransferase  36.08 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1111  aromatic amino acid aminotransferase  36.08 
 
 		 400 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4592  aromatic amino acid aminotransferase  36.04 
 
 		 397 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.535165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4541  aromatic amino acid aminotransferase  35.79 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01010  aromatic amino acid aminotransferase  36.36 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00165068  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4591  aromatic amino acid aminotransferase  35.79 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  36.2 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3939  Aromatic-amino-acid transaminase  35.79 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0735  aromatic amino acid aminotransferase  35.53 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.160604  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  37.63 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03926  tyrosine aminotransferase, tyrosine-repressible, PLP-dependent  35.79 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0286494  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4505  aromatic amino acid aminotransferase  35.79 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03886  hypothetical protein  35.79 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0274153  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3974  aromatic amino acid aminotransferase  35.79 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4497  aromatic amino acid aminotransferase  35.79 
 
 		 397 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4294  aromatic amino acid aminotransferase  35.79 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.820451  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3097  aromatic amino acid aminotransferase  35.97 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>