21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11736 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11736  biotin carboxylase-like protein  100 
 
 		 494 aa  1015    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000368956  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4956  biotin carboxylase-like protein  45.21 
 
 		 541 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0972  pyruvate carboxylase  27.54 
 
 		 1165 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_004310  BR1781  pyruvate carboxylase  26.27 
 
 		 1158 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0402  pyruvate carboxylase  28.1 
 
 		 1147 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1716  pyruvate carboxylase  26.27 
 
 		 1158 aa  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0466  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  26.05 
 
 		 1862 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5682  protein of unknown function DUF201  20 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4375  pyruvate carboxylase  25.11 
 
 		 1153 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0096  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  28.51 
 
 		 587 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.800977  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4167  pyruvate carboxylase  24.19 
 
 		 1154 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3139  pyruvate carboxylase  26.36 
 
 		 1184 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0690  pyruvate carboxylase  27.27 
 
 		 1230 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.775311  normal  0.465507 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2308  pyruvate carboxylase  27.27 
 
 		 1229 aa  44.7  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2327  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  24.55 
 
 		 450 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000401925  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4717  pyruvate carboxylase  26.03 
 
 		 1169 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6118  pyruvate carboxylase  24.19 
 
 		 1165 aa  43.9  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.410789 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2485  pyruvate carboxylase  26.7 
 
 		 1145 aa  43.9  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4238  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding  25.42 
 
 		 1827 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3259  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  24.68 
 
 		 659 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2423  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  29.36 
 
 		 1843 aa  43.5  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.757589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>