18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0654 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0654  photosystem I assembly protein Ycf4  100 
 
 		 188 aa  373  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1241  photosystem I assembly protein Ycf4  69.32 
 
 		 198 aa  256  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1058  photosystem I assembly Ycf4  67.05 
 
 		 189 aa  248  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0653893  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0542  photosystem I assembly protein Ycf4  61.17 
 
 		 188 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0559  photosystem I assembly protein Ycf4  61.17 
 
 		 188 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1057  photosystem I assembly protein Ycf4  60.11 
 
 		 188 aa  244  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0580  photosystem I assembly protein Ycf4  63.19 
 
 		 183 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0512  photosystem I assembly protein Ycf4  55.68 
 
 		 187 aa  215  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0669  photosystem I assembly protein Ycf4  59.09 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175754  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1991  photosystem I assembly protein Ycf4  56.25 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0951531  normal  0.238348 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08451  photosystem I assembly protein Ycf4  52.81 
 
 		 191 aa  187  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12321  photosystem I assembly protein Ycf4  52.54 
 
 		 183 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.822853  normal  0.0759453 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0766  photosystem I assembly protein Ycf4  49.43 
 
 		 191 aa  164  8e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16061  photosystem I assembly protein Ycf4  49.43 
 
 		 191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.505806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13231  photosystem I assembly protein Ycf4  42.46 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.543235  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13331  photosystem I assembly protein Ycf4  43.02 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.403365  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13481  photosystem I assembly protein Ycf4  42.46 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1255  photosystem I assembly protein Ycf4  41.34 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>