18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0580 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0580  photosystem I assembly protein Ycf4  100 
 
 		 183 aa  367  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0559  photosystem I assembly protein Ycf4  72.68 
 
 		 188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0542  photosystem I assembly protein Ycf4  72.68 
 
 		 188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1058  photosystem I assembly Ycf4  71.98 
 
 		 189 aa  276  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0653893  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1241  photosystem I assembly protein Ycf4  69.23 
 
 		 198 aa  272  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1057  photosystem I assembly protein Ycf4  65.57 
 
 		 188 aa  262  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001248 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0512  photosystem I assembly protein Ycf4  64.29 
 
 		 187 aa  256  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0654  photosystem I assembly protein Ycf4  63.19 
 
 		 188 aa  221  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0669  photosystem I assembly protein Ycf4  50 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175754  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08451  photosystem I assembly protein Ycf4  51.7 
 
 		 191 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1991  photosystem I assembly protein Ycf4  49.44 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0951531  normal  0.238348 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0766  photosystem I assembly protein Ycf4  46.63 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16061  photosystem I assembly protein Ycf4  46.07 
 
 		 191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.505806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12321  photosystem I assembly protein Ycf4  43.18 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.822853  normal  0.0759453 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13231  photosystem I assembly protein Ycf4  42.94 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.543235  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13331  photosystem I assembly protein Ycf4  42.37 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.403365  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13481  photosystem I assembly protein Ycf4  42.94 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1255  photosystem I assembly protein Ycf4  42.94 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>