18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0542 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0559  photosystem I assembly protein Ycf4  100 
 
 		 188 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0542  photosystem I assembly protein Ycf4  100 
 
 		 188 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0580  photosystem I assembly protein Ycf4  72.68 
 
 		 183 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1241  photosystem I assembly protein Ycf4  63.74 
 
 		 198 aa  252  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1057  photosystem I assembly protein Ycf4  63.83 
 
 		 188 aa  249  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001248 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1058  photosystem I assembly Ycf4  63.28 
 
 		 189 aa  248  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0653893  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0512  photosystem I assembly protein Ycf4  57.98 
 
 		 187 aa  238  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0654  photosystem I assembly protein Ycf4  61.17 
 
 		 188 aa  227  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0669  photosystem I assembly protein Ycf4  48.59 
 
 		 178 aa  181  7e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175754  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1991  photosystem I assembly protein Ycf4  47.46 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0951531  normal  0.238348 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08451  photosystem I assembly protein Ycf4  46.02 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12321  photosystem I assembly protein Ycf4  43.5 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.822853  normal  0.0759453 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0766  photosystem I assembly protein Ycf4  41.01 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16061  photosystem I assembly protein Ycf4  41.01 
 
 		 191 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.505806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13231  photosystem I assembly protein Ycf4  40.68 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.543235  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13331  photosystem I assembly protein Ycf4  39.15 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.403365  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13481  photosystem I assembly protein Ycf4  39.15 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1255  photosystem I assembly protein Ycf4  39.68 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>