26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0206 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0206  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
462 aa  947    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.844117 
 
 
-
 
NC_003296  RS05359  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  55.6 
 
 
483 aa  522  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.93014  normal  0.100759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04293  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  56.28 
 
 
467 aa  521  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0826  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  55.72 
 
 
477 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal  0.0576382 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5413  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  54.68 
 
 
475 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.592794 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3480  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  55.08 
 
 
477 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0732937  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4886  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  55.08 
 
 
477 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4792  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  55.15 
 
 
477 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118742  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5400  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  54.86 
 
 
477 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1188  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  54.31 
 
 
480 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.59249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2845  Nicotinamide phosphoribosyltransferase  54.7 
 
 
463 aa  504  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4266  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  54.51 
 
 
477 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0308857 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5105  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  54.43 
 
 
477 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000147832  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0680  Nicotinamide phosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
475 aa  490  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1914  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  53.06 
 
 
465 aa  485  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00410078  hitchhiker  0.000251538 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2205  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  53.26 
 
 
465 aa  484  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0518975  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1852  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  51.64 
 
 
465 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000306187 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0002  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  50.43 
 
 
465 aa  456  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.485166  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0022  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  47.28 
 
 
454 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.450497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0607  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  42.43 
 
 
471 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173144  normal  0.570319 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0131  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 
472 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504568  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1981  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.68 
 
 
490 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2326  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 
490 aa  237  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0745  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  31.57 
 
 
489 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2424  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  29.07 
 
 
488 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1180  nicotinate phosphoribosyltransferase  20.95 
 
 
458 aa  48.9  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.690233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>