25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4266 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05359  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  78.78 
 
 		 483 aa  781    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.93014  normal  0.100759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0826  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  91.6 
 
 		 477 aa  904    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal  0.0576382 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1188  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  78.29 
 
 		 480 aa  786    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59249 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5105  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  76.68 
 
 		 477 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000147832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3480  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  93.07 
 
 		 477 aa  913    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0732937  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5413  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  77.24 
 
 		 475 aa  776    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.592794 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4792  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  98.74 
 
 		 477 aa  969    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4266  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 477 aa  979    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0308857 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4886  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  93.07 
 
 		 477 aa  913    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5400  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  93.07 
 
 		 477 aa  913    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04293  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  62.82 
 
 		 467 aa  597  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0206  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  54.51 
 
 		 462 aa  501  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.844117 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1852  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  52.45 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306187 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0680  Nicotinamide phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 		 475 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2845  Nicotinamide phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 		 463 aa  465  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2205  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  48.94 
 
 		 465 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0518975  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1914  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  48.94 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00410078  hitchhiker  0.000251538 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0002  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  47.76 
 
 		 465 aa  450  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.485166  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0022  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  50.11 
 
 		 454 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.450497  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0131  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  44.37 
 
 		 472 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0607  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  42.02 
 
 		 471 aa  360  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173144  normal  0.570319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1981  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  33.6 
 
 		 490 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2326  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  33.6 
 
 		 490 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0745  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 		 489 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2424  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  29.4 
 
 		 488 aa  226  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>