25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1981 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1981  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 490 aa  1021    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2326  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  98.36 
 
 		 490 aa  1003    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0745  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  59.38 
 
 		 489 aa  609  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2424  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 488 aa  466  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5413  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 475 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.592794 
 
 
-
 
NC_003296  RS05359  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.52 
 
 		 483 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.93014  normal  0.100759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1188  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.07 
 
 		 480 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59249 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0002  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  33.81 
 
 		 465 aa  256  6e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.485166  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4266  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  33.6 
 
 		 477 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0308857 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4792  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  33.2 
 
 		 477 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0607  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 		 471 aa  250  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173144  normal  0.570319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0826  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34 
 
 		 477 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal  0.0576382 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4886  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  33.2 
 
 		 477 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3480  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  33.2 
 
 		 477 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0732937  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0680  Nicotinamide phosphoribosyltransferase  33.27 
 
 		 475 aa  246  6e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5105  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 		 477 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000147832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1852  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  35.38 
 
 		 465 aa  243  6e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5400  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  33 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0206  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.68 
 
 		 462 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.844117 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2205  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 		 465 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0518975  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04293  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  32.01 
 
 		 467 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0022  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  33.4 
 
 		 454 aa  233  8.000000000000001e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.450497  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1914  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.23 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00410078  hitchhiker  0.000251538 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0131  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 472 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504568  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2845  Nicotinamide phosphoribosyltransferase  30.49 
 
 		 463 aa  193  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>