25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0131 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0131  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 472 aa  979    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.504568  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0002  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  46.3 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.485166  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1914  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 465 aa  413  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00410078  hitchhiker  0.000251538 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2205  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0518975  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1852  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  45.43 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04293  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  44.33 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0022  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.450497  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05359  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 		 483 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.93014  normal  0.100759 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4266  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  44.37 
 
 		 477 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0308857 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0826  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 		 477 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.708537  normal  0.0576382 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5400  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  44.52 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4792  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 		 477 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.118742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3480  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  44.3 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0732937  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4886  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  44.3 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5413  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  44.16 
 
 		 475 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.592794 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5105  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  44.3 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000147832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1188  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  43.23 
 
 		 480 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0206  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  41.94 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.844117 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0680  Nicotinamide phosphoribosyltransferase  40.3 
 
 		 475 aa  361  1e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2845  Nicotinamide phosphoribosyltransferase  42.61 
 
 		 463 aa  359  5e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0607  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  37.13 
 
 		 471 aa  312  9e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173144  normal  0.570319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1981  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2326  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  30.06 
 
 		 490 aa  205  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0745  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  27.52 
 
 		 489 aa  203  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2424  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  27.79 
 
 		 488 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>