More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1916 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1916  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  100 
 
 
345 aa  706    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.344897  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0414  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  77.97 
 
 
368 aa  542  1e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.857995  normal  0.174221 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22491  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  70.72 
 
 
345 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  65.32 
 
 
346 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.812351  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1164  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.45 
 
 
346 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17101  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  64.35 
 
 
345 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.199826  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17761  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.02 
 
 
347 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17811  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.31 
 
 
347 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1681  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.01 
 
 
347 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17981  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.93 
 
 
347 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.742703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5338  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  59.58 
 
 
342 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1440  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.63 
 
 
363 aa  378  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2617  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.33 
 
 
343 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.167412  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1856  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.59 
 
 
349 aa  368  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3499  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.33 
 
 
343 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1624  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.15 
 
 
349 aa  363  2e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133695 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1064  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.52 
 
 
345 aa  361  9e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3196  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.76 
 
 
346 aa  360  3e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00297919  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2992  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.61 
 
 
345 aa  360  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3341  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.37 
 
 
367 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2801  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  55.29 
 
 
332 aa  356  3.9999999999999996e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840794  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2744  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.93 
 
 
345 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000181532  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0946  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.15 
 
 
354 aa  354  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1845  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.17 
 
 
345 aa  353  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000474517  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0205  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.93 
 
 
346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1819  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.28 
 
 
346 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3187  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.19 
 
 
345 aa  352  8e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02148  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.06 
 
 
346 aa  351  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1129  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.89 
 
 
345 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002781  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50 
 
 
346 aa  350  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1293  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.43 
 
 
350 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.14528e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1551  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.76 
 
 
345 aa  350  2e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3524  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.67 
 
 
359 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00772577  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03200  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50 
 
 
346 aa  349  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2106  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.19 
 
 
349 aa  348  7e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2094  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.28 
 
 
345 aa  348  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188129  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2808  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  48.7 
 
 
352 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247614  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2402  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.24 
 
 
348 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.507579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1817  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.53 
 
 
348 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980836 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0851  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.68 
 
 
341 aa  346  3e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0951895  normal  0.025674 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1720  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.14 
 
 
368 aa  346  3e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1730  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.28 
 
 
345 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000522816  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3120  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.12 
 
 
347 aa  346  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1234  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.12 
 
 
347 aa  345  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.701579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1351  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.12 
 
 
347 aa  345  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1513  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.67 
 
 
345 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000222973  normal  0.483677 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1182  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.02 
 
 
358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.66248  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36890  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.57 
 
 
351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2390  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.82 
 
 
346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2364  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.16 
 
 
350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2097  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.67 
 
 
345 aa  342  4e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1650  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  56.29 
 
 
368 aa  342  4e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.81226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1772  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.85 
 
 
350 aa  342  4e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000204477  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.98 
 
 
345 aa  342  5e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00640096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2577  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.06 
 
 
346 aa  342  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0230981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2153  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.47 
 
 
348 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000138623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1046  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  52.12 
 
 
347 aa  342  7e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1700  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.3 
 
 
352 aa  341  9e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02391  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.29 
 
 
345 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0803604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1170  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.29 
 
 
345 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1758  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  53.27 
 
 
348 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0373  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.62 
 
 
345 aa  341  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.29 
 
 
345 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2634  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.29 
 
 
345 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.302094  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2873  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.29 
 
 
345 aa  341  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.636308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02353  hypothetical protein  50.29 
 
 
345 aa  341  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0952896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2782  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.29 
 
 
345 aa  340  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.171997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1177  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.29 
 
 
345 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0570522 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2760  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.89 
 
 
352 aa  340  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3689  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50 
 
 
352 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  decreased coverage  0.000265107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1844  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.61 
 
 
348 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0176696  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2549  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.28 
 
 
345 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000317859  hitchhiker  0.000000000231938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1773  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.28 
 
 
345 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00650722  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2380  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.89 
 
 
345 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0437006  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2452  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.89 
 
 
345 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.038607  normal  0.28403 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1735  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.28 
 
 
345 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000490358  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2545  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  52.89 
 
 
345 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000355661  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0656  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.48 
 
 
343 aa  339  4e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.597374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2988  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.83 
 
 
345 aa  339  5e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3722  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50 
 
 
345 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.108743  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1069  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  50.15 
 
 
348 aa  338  5.9999999999999996e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.750987  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0265  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.46 
 
 
363 aa  338  7e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1928  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.46 
 
 
352 aa  338  8e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2253  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  51.81 
 
 
356 aa  337  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2112  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  53.59 
 
 
358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1596  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  51.98 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000121366  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2737  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.41 
 
 
345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2759  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.41 
 
 
345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.168086  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2868  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.41 
 
 
345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2695  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.41 
 
 
350 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2647  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.41 
 
 
350 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.42877  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3150  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  54.46 
 
 
342 aa  335  5e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0894  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.61 
 
 
369 aa  335  7.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000980143 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0516  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  54.85 
 
 
347 aa  333  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.706713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2996  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.66 
 
 
352 aa  333  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.55909  hitchhiker  0.000666575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1633  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  49.7 
 
 
352 aa  333  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1223  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.81 
 
 
352 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0174491  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2489  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  50.15 
 
 
345 aa  332  5e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.742519  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1263  phosphoribosylaminoimidazole synthetase  48.81 
 
 
352 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.045095 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0310  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  49.7 
 
 
346 aa  331  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>