26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1695 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1695  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  418  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.734348  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0665  hypothetical protein  80 
 
 
215 aa  308  5.9999999999999995e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.402114  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0084  hypothetical protein  32.8 
 
 
233 aa  85.1  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.956959  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4446  hypothetical protein  31.48 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.480121  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0222  hypothetical protein  34.15 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.01063  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1290  hypothetical protein  31.38 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000122843  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3286  hypothetical protein  30.86 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2837  hypothetical protein  30.86 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.819416 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4211  hypothetical protein  30.77 
 
 
223 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3097  hypothetical protein  27.78 
 
 
200 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.832851  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_6402  predicted protein  34.19 
 
 
170 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3874  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.1 
 
 
655 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173142 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4334  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.1 
 
 
655 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530372  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1574  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.74 
 
 
666 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580758  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1194  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.74 
 
 
666 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.256631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1487  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.74 
 
 
666 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.643997  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0389  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.74 
 
 
666 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.74 
 
 
662 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231073  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.74 
 
 
666 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643588  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5863  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.1 
 
 
658 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0798132  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0851  cell division protein FtsH  36.05 
 
 
637 aa  42.4  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.74 
 
 
852 aa  42  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.16452  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1520  FtsH-2 peptidase  38.1 
 
 
692 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428329  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0074  FtsH-2 protease  37.74 
 
 
917 aa  42  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00600041  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.71 
 
 
646 aa  41.6  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.85 
 
 
653 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>