67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0560 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0560  penicillin-insensitive murein endopeptidase  100 
 
 		 278 aa  579  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0543  penicillin-insensitive murein endopeptidase  55.16 
 
 		 294 aa  271  6e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004390  murein endopeptidase  48.9 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01020  penicillin-insensitive murein endopeptidase  47.81 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3469  penicillin-insensitive murein endopeptidase  46.91 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1204  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.44 
 
 		 279 aa  231  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1328  peptidase U6 penicillin-insensitive murein endopeptidase  46.91 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1324  penicillin-insensitive murein endopeptidase  46.91 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2623  penicillin-insensitive murein endopeptidase  46.91 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2480  penicillin-insensitive murein endopeptidase  46.91 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02253  penicillin-insensitive murein endopeptidase  46.91 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2485  penicillin-insensitive murein endopeptidase  47.33 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.765276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02213  hypothetical protein  46.91 
 
 		 274 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2706  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.88 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2736  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.13 
 
 		 274 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2523  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.13 
 
 		 274 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2612  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.13 
 
 		 274 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2572  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.13 
 
 		 274 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2625  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.13 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.644795  hitchhiker  0.000000497544 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1515  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.53 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1454  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.56 
 
 		 281 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1406  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.4 
 
 		 275 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.277424  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0376  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.53 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3373  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.38 
 
 		 275 aa  222  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2876  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.27 
 
 		 274 aa  221  9e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0818548  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2810  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.06 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6120  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.64 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2592  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.63 
 
 		 276 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1346  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.69 
 
 		 269 aa  208  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3098  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.27 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2663  penicillin-insensitive murein endopeptidase  39.55 
 
 		 307 aa  198  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2659  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.39 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3607  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.25 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3284  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.25 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0021  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.7 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1139  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.05 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0305084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3596  penicillin-insensitive murein endopeptidase  40.93 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3484  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.34 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.395907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0450  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.05 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.0724042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2176  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.14 
 
 		 311 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3338  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.02 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4516  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.36 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0344  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.41 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5739  penicillin-insensitive murein endopeptidase  40.53 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3296  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.59 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00347762 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1363  penicillin-insensitive murein endopeptidase  37.88 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0031  penicillin-insensitive murein endopeptidase  37.88 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3367  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.42 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0394  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.15 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1047  penicillin-insensitive murein endopeptidase  39.51 
 
 		 340 aa  178  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0158  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.34 
 
 		 317 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0985  penicillin-insensitive murein endopeptidase  39.92 
 
 		 340 aa  178  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1334  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.59 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0437  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.7 
 
 		 320 aa  175  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1690  penicillin-insensitive murein endopeptidase  36.17 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0581  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.4 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.29607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7377  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.63 
 
 		 313 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0341  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.26 
 
 		 350 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0051  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.63 
 
 		 318 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0241  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.89 
 
 		 336 aa  165  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4445  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.64 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.710373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4131  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.18 
 
 		 358 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0461915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.73 
 
 		 377 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6708  hypothetical protein  26.64 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2785  peptidoglycan-binding LysM  26.6 
 
 		 647 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1831  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.48 
 
 		 323 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2151  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.19 
 
 		 306 aa  42.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0511643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>