32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6708 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6708  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  634    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4794  hypothetical protein  40.87 
 
 		 329 aa  146  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2785  peptidoglycan-binding LysM  28 
 
 		 647 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7377  penicillin-insensitive murein endopeptidase  24.72 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3098  penicillin-insensitive murein endopeptidase  29.61 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.16 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0543  penicillin-insensitive murein endopeptidase  26.46 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0560  penicillin-insensitive murein endopeptidase  26.64 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3484  penicillin-insensitive murein endopeptidase  28.14 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.395907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3284  penicillin-insensitive murein endopeptidase  28.12 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3338  penicillin-insensitive murein endopeptidase  25.2 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3607  penicillin-insensitive murein endopeptidase  27.68 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0450  penicillin-insensitive murein endopeptidase  27.17 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.0724042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1139  penicillin-insensitive murein endopeptidase  26.13 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0305084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2176  penicillin-insensitive murein endopeptidase  26.58 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1690  penicillin-insensitive murein endopeptidase  28.04 
 
 		 279 aa  50.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0344  penicillin-insensitive murein endopeptidase  29.69 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2659  penicillin-insensitive murein endopeptidase  26.09 
 
 		 290 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0581  penicillin-insensitive murein endopeptidase  26.15 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.29607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0051  penicillin-insensitive murein endopeptidase  24.4 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4516  penicillin-insensitive murein endopeptidase  25.47 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3373  penicillin-insensitive murein endopeptidase  27.4 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0437  penicillin-insensitive murein endopeptidase  23.61 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2804  methionine synthase  29.77 
 
 		 1274 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.294328 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01020  penicillin-insensitive murein endopeptidase  25.99 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5739  penicillin-insensitive murein endopeptidase  27.14 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0341  penicillin-insensitive murein endopeptidase  24.02 
 
 		 350 aa  43.9  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1454  penicillin-insensitive murein endopeptidase  26.01 
 
 		 281 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004390  murein endopeptidase  27.1 
 
 		 278 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0021  penicillin-insensitive murein endopeptidase  25.62 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0158  penicillin-insensitive murein endopeptidase  24.88 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1204  penicillin-insensitive murein endopeptidase  24.64 
 
 		 279 aa  42.7  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>