64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2810 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2810  penicillin-insensitive murein endopeptidase  100 
 
 		 281 aa  577  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1454  penicillin-insensitive murein endopeptidase  95.02 
 
 		 281 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1346  penicillin-insensitive murein endopeptidase  79.55 
 
 		 269 aa  435  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2592  penicillin-insensitive murein endopeptidase  78.44 
 
 		 276 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1406  penicillin-insensitive murein endopeptidase  72.24 
 
 		 275 aa  417  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.277424  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0376  penicillin-insensitive murein endopeptidase  76.36 
 
 		 268 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1515  penicillin-insensitive murein endopeptidase  76.36 
 
 		 268 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2736  penicillin-insensitive murein endopeptidase  69.78 
 
 		 274 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2523  penicillin-insensitive murein endopeptidase  69.78 
 
 		 274 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2612  penicillin-insensitive murein endopeptidase  69.78 
 
 		 274 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2572  penicillin-insensitive murein endopeptidase  69.78 
 
 		 274 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2876  penicillin-insensitive murein endopeptidase  72.62 
 
 		 274 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0818548  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2625  penicillin-insensitive murein endopeptidase  69.4 
 
 		 274 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.644795  hitchhiker  0.000000497544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3373  penicillin-insensitive murein endopeptidase  70.82 
 
 		 275 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2485  penicillin-insensitive murein endopeptidase  71.43 
 
 		 274 aa  386  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.765276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1324  penicillin-insensitive murein endopeptidase  71.03 
 
 		 274 aa  384  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02213  hypothetical protein  71.03 
 
 		 274 aa  384  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02253  penicillin-insensitive murein endopeptidase  71.03 
 
 		 274 aa  384  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2623  penicillin-insensitive murein endopeptidase  71.03 
 
 		 274 aa  384  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1328  peptidase U6 penicillin-insensitive murein endopeptidase  71.03 
 
 		 274 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2706  penicillin-insensitive murein endopeptidase  71.03 
 
 		 274 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2480  penicillin-insensitive murein endopeptidase  71.03 
 
 		 274 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3469  penicillin-insensitive murein endopeptidase  70.63 
 
 		 274 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004390  murein endopeptidase  45.55 
 
 		 278 aa  254  9e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1204  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.75 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01020  penicillin-insensitive murein endopeptidase  40.77 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0560  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.39 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5739  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.68 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3098  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.67 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3484  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.93 
 
 		 309 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.395907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0543  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.18 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1139  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.37 
 
 		 307 aa  205  8e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0305084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3607  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.49 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2176  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.93 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3284  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.05 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6120  penicillin-insensitive murein endopeptidase  39.25 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0985  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.6 
 
 		 340 aa  195  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0450  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.72 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.0724042 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1047  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.2 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0158  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.32 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3296  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.94 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00347762 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0341  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.12 
 
 		 350 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0581  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.36 
 
 		 312 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.29607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1334  penicillin-insensitive murein endopeptidase  43.6 
 
 		 310 aa  185  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4516  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.48 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7377  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.6 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0437  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.2 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0394  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.66 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3367  penicillin-insensitive murein endopeptidase  39.37 
 
 		 355 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0051  penicillin-insensitive murein endopeptidase  40.83 
 
 		 318 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2659  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.93 
 
 		 290 aa  175  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3596  penicillin-insensitive murein endopeptidase  37.35 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1690  penicillin-insensitive murein endopeptidase  35.9 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0241  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4445  penicillin-insensitive murein endopeptidase  39.47 
 
 		 358 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.710373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4131  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.16 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0461915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2663  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.58 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0021  penicillin-insensitive murein endopeptidase  34.75 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1363  penicillin-insensitive murein endopeptidase  36.89 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0031  penicillin-insensitive murein endopeptidase  36.89 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0344  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.06 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3338  penicillin-insensitive murein endopeptidase  35.71 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  24.89 
 
 		 377 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2785  peptidoglycan-binding LysM  24.49 
 
 		 647 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>