57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0395 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0395  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0303  hypothetical protein  75.81 
 
 		 130 aa  205  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4199  hypothetical protein  72.44 
 
 		 130 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0259  hypothetical protein  75.4 
 
 		 133 aa  191  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510441  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0404  hypothetical protein  71.88 
 
 		 130 aa  190  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.455973  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3845  hypothetical protein  68.5 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.989826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3649  hypothetical protein  68.5 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0295  hypothetical protein  68.5 
 
 		 133 aa  174  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3326  hypothetical protein  66.93 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00885978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4160  hypothetical protein  65.35 
 
 		 132 aa  166  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.951952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3965  hypothetical protein  65.35 
 
 		 132 aa  166  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.529125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4042  hypothetical protein  64.84 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0324  hypothetical protein  64.57 
 
 		 133 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3663  hypothetical protein  64.06 
 
 		 133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.281432  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4067  hypothetical protein  64.57 
 
 		 132 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05694  hypothetical protein  59.66 
 
 		 128 aa  153  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000081  hypothetical protein  57.38 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2303  hypothetical protein  56 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.385358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0801  hypothetical protein  44.68 
 
 		 113 aa  97.1  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0218  hypothetical protein  43.96 
 
 		 101 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1958  hypothetical protein  42.48 
 
 		 133 aa  95.9  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.140682  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0219  hypothetical protein  42.86 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0573  hypothetical protein  44.21 
 
 		 113 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000392083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1895  hypothetical protein  42.57 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407598  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2188  hypothetical protein  42.57 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.843382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3209  hypothetical protein  39.81 
 
 		 116 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3170  hypothetical protein  39.05 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.740312 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3013  hypothetical protein  39.05 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0169522 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3049  hypothetical protein  39.05 
 
 		 114 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997859 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3145  hypothetical protein  39.45 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02547  hypothetical protein  39.45 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.950234  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0957  conserved hypothetical protein  39.45 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0980  hypothetical protein  39.45 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02582  hypothetical protein  39.45 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3020  hypothetical protein  39.45 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2869  hypothetical protein  39.45 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2858  hypothetical protein  39.45 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2982  hypothetical protein  38.1 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3065  hypothetical protein  38.1 
 
 		 114 aa  86.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286302  normal  0.0781246 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3984  hypothetical protein  39.45 
 
 		 117 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02270  hypothetical protein  41.58 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0274  hypothetical protein  39.39 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1421  hypothetical protein  41.58 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0950425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2046  hypothetical protein  43.01 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00536411  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2307  hypothetical protein  34.58 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.58575e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0209  hypothetical protein  35.71 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1046  hypothetical protein  38.3 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3448  hypothetical protein  32.97 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0306  hypothetical protein  28.16 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0136  hypothetical protein  29.67 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0293  hypothetical protein  27.19 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000641316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0152  hypothetical protein  29.67 
 
 		 104 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000026617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3184  hypothetical protein  28.7 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000292442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3248  hypothetical protein  31.96 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0260  hypothetical protein  29.13 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1084  hypothetical protein  26.61 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00346286  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0132  hypothetical protein  27.88 
 
 		 119 aa  40  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>