57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0293 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0293  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  245  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000641316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3248  hypothetical protein  62.18 
 
 
118 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3184  hypothetical protein  58.82 
 
 
134 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000292442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0136  hypothetical protein  53.98 
 
 
104 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0152  hypothetical protein  52.21 
 
 
104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000026617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0306  hypothetical protein  51.67 
 
 
118 aa  121  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3448  hypothetical protein  47.46 
 
 
114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0324  hypothetical protein  26.72 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02270  hypothetical protein  30.84 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0219  hypothetical protein  32.73 
 
 
101 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3845  hypothetical protein  28.45 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.989826  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4042  hypothetical protein  28.45 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4067  hypothetical protein  28.45 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0218  hypothetical protein  31.82 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4199  hypothetical protein  25.42 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0295  hypothetical protein  27.59 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3649  hypothetical protein  27.59 
 
 
133 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01691  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000081  hypothetical protein  28.21 
 
 
129 aa  60.1  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281171  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4160  hypothetical protein  27.59 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.951952  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3965  hypothetical protein  27.59 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.529125  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05694  hypothetical protein  29.06 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0259  hypothetical protein  26.27 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510441  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0303  hypothetical protein  24.56 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2307  hypothetical protein  29.73 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.58575e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3326  hypothetical protein  25.64 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00885978  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0395  hypothetical protein  27.19 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0260  hypothetical protein  35.51 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3663  hypothetical protein  24.58 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.281432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1895  hypothetical protein  33.73 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407598  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2188  hypothetical protein  33.73 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.843382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0801  hypothetical protein  38.24 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0573  hypothetical protein  28.18 
 
 
113 aa  52  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000392083  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0404  hypothetical protein  25.23 
 
 
130 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.455973  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1421  hypothetical protein  26.5 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0950425  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1084  hypothetical protein  32.32 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00346286  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2303  hypothetical protein  30.7 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.385358  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0274  hypothetical protein  36.36 
 
 
105 aa  47  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0209  hypothetical protein  43.64 
 
 
111 aa  47  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2046  hypothetical protein  38.98 
 
 
131 aa  47  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00536411  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1958  hypothetical protein  44.23 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.140682  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3065  hypothetical protein  30.59 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286302  normal  0.0781246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2982  hypothetical protein  30.59 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3049  hypothetical protein  30.59 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3013  hypothetical protein  30.59 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0169522 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3170  hypothetical protein  30.59 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.740312 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3209  hypothetical protein  39.29 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2858  hypothetical protein  38.46 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0957  conserved hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02582  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02547  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.950234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3984  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3145  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0980  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3020  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2869  hypothetical protein  35 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1046  hypothetical protein  43.18 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0132  hypothetical protein  29.09 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>