56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4199 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_4199  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0303  hypothetical protein  75 
 
 
130 aa  196  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0395  hypothetical protein  72.44 
 
 
127 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0259  hypothetical protein  73.77 
 
 
133 aa  189  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510441  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0404  hypothetical protein  67.69 
 
 
130 aa  185  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.455973  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3663  hypothetical protein  63.64 
 
 
133 aa  173  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.281432  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3965  hypothetical protein  65.6 
 
 
132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.529125  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4160  hypothetical protein  64.8 
 
 
132 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.951952  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4042  hypothetical protein  64.8 
 
 
132 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4067  hypothetical protein  64 
 
 
132 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3326  hypothetical protein  65.85 
 
 
129 aa  167  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00885978  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3845  hypothetical protein  63.2 
 
 
133 aa  167  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.989826  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3649  hypothetical protein  63.2 
 
 
133 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01691  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0295  hypothetical protein  63.2 
 
 
133 aa  166  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0324  hypothetical protein  60 
 
 
133 aa  160  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05694  hypothetical protein  58.82 
 
 
128 aa  154  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000081  hypothetical protein  56.1 
 
 
129 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2303  hypothetical protein  55.64 
 
 
132 aa  147  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.385358  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0573  hypothetical protein  42.86 
 
 
113 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000392083  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0218  hypothetical protein  46.94 
 
 
101 aa  98.6  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0801  hypothetical protein  42.55 
 
 
113 aa  97.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0219  hypothetical protein  45.92 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1958  hypothetical protein  41.44 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.140682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2188  hypothetical protein  44.44 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.843382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1895  hypothetical protein  40.68 
 
 
143 aa  94.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2858  hypothetical protein  41.51 
 
 
114 aa  94  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3145  hypothetical protein  41.51 
 
 
117 aa  93.6  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02547  hypothetical protein  41.51 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.950234  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0957  conserved hypothetical protein  41.51 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3020  hypothetical protein  41.51 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2869  hypothetical protein  41.51 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0980  hypothetical protein  41.51 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.331208 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02582  hypothetical protein  41.51 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3984  hypothetical protein  41.51 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3209  hypothetical protein  41.51 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3065  hypothetical protein  39.22 
 
 
114 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286302  normal  0.0781246 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3049  hypothetical protein  39.22 
 
 
114 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3013  hypothetical protein  39.22 
 
 
114 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0169522 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2982  hypothetical protein  39.22 
 
 
114 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3170  hypothetical protein  39.22 
 
 
114 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.740312 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02270  hypothetical protein  40.59 
 
 
130 aa  88.2  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2046  hypothetical protein  46.46 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00536411  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0274  hypothetical protein  39.39 
 
 
105 aa  83.6  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2307  hypothetical protein  37.37 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.58575e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1421  hypothetical protein  37.25 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0950425  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1046  hypothetical protein  37.23 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0209  hypothetical protein  31.07 
 
 
111 aa  70.1  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3448  hypothetical protein  29.13 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0136  hypothetical protein  33.7 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0152  hypothetical protein  34.78 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000026617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0293  hypothetical protein  25.42 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000641316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0306  hypothetical protein  24.55 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3184  hypothetical protein  31.13 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000292442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3248  hypothetical protein  27.52 
 
 
118 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0260  hypothetical protein  41.79 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1084  hypothetical protein  27.78 
 
 
116 aa  47  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00346286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>