54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_02547 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0957  conserved hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  240  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02547  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  240  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.950234  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0980  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  240  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3020  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  240  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2869  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  240  6e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02582  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  240  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3145  hypothetical protein  99.15 
 
 
117 aa  237  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3984  hypothetical protein  98.29 
 
 
117 aa  233  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2858  hypothetical protein  98.25 
 
 
114 aa  231  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2982  hypothetical protein  88.6 
 
 
114 aa  209  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3170  hypothetical protein  87.72 
 
 
114 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.740312 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3013  hypothetical protein  87.72 
 
 
114 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0169522 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3049  hypothetical protein  87.72 
 
 
114 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3065  hypothetical protein  87.72 
 
 
114 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286302  normal  0.0781246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3209  hypothetical protein  84.21 
 
 
116 aa  202  9e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1958  hypothetical protein  58.12 
 
 
133 aa  139  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.140682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1895  hypothetical protein  58.93 
 
 
143 aa  134  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407598  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2188  hypothetical protein  59.46 
 
 
125 aa  133  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.843382  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2046  hypothetical protein  62.24 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00536411  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3326  hypothetical protein  45.87 
 
 
129 aa  102  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00885978  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2303  hypothetical protein  42.48 
 
 
132 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.385358  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000081  hypothetical protein  45.19 
 
 
129 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281171  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05694  hypothetical protein  44.23 
 
 
128 aa  100  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0303  hypothetical protein  44.04 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0324  hypothetical protein  55.41 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3845  hypothetical protein  43.75 
 
 
133 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.989826  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4199  hypothetical protein  41.51 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3649  hypothetical protein  43.75 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01691  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0295  hypothetical protein  43.75 
 
 
133 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0404  hypothetical protein  38.46 
 
 
130 aa  91.7  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.455973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0801  hypothetical protein  46.23 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0259  hypothetical protein  44.64 
 
 
133 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510441  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0573  hypothetical protein  39.81 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000392083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4067  hypothetical protein  41.07 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3965  hypothetical protein  40.18 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.529125  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4160  hypothetical protein  40.18 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.951952  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4042  hypothetical protein  40.18 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0395  hypothetical protein  39.45 
 
 
127 aa  88.2  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3663  hypothetical protein  49.32 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.281432  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1046  hypothetical protein  40 
 
 
116 aa  86.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1421  hypothetical protein  37.14 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0950425  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0219  hypothetical protein  42.71 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0218  hypothetical protein  41.67 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0209  hypothetical protein  31.13 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02270  hypothetical protein  38.68 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2307  hypothetical protein  42.86 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.58575e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0274  hypothetical protein  38.98 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3448  hypothetical protein  46.15 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0306  hypothetical protein  42.86 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0152  hypothetical protein  37.74 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000026617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0136  hypothetical protein  37.74 
 
 
104 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0293  hypothetical protein  35 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000641316  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0260  hypothetical protein  37.74 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3184  hypothetical protein  30.65 
 
 
134 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000292442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>