34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1084 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1084  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  235  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00346286  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0132  hypothetical protein  52.63 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0260  hypothetical protein  42.98 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1018  hypothetical protein  34.21 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000081  hypothetical protein  31.73 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281171  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05694  hypothetical protein  34 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0293  hypothetical protein  32.32 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000641316  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0324  hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0295  hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3649  hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0573  hypothetical protein  27.36 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000392083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3663  hypothetical protein  30.77 
 
 		 133 aa  50.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.281432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0404  hypothetical protein  28.44 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.455973  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0306  hypothetical protein  28.16 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3326  hypothetical protein  27.72 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00885978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0303  hypothetical protein  26.85 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4042  hypothetical protein  30.93 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4067  hypothetical protein  30.93 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3845  hypothetical protein  35.8 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.989826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3448  hypothetical protein  28.83 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2303  hypothetical protein  30.69 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.385358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0259  hypothetical protein  30.48 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510441  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4199  hypothetical protein  27.78 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4160  hypothetical protein  29.9 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.951952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3965  hypothetical protein  27.78 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.529125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0395  hypothetical protein  26.61 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02270  hypothetical protein  29.59 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0136  hypothetical protein  42.86 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0152  hypothetical protein  41.07 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000026617  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2307  hypothetical protein  31.96 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.58575e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0219  hypothetical protein  38.46 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0218  hypothetical protein  38.46 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0801  hypothetical protein  37.93 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3184  hypothetical protein  26.61 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000292442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>