56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2303 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2303  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  275  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.385358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3326  hypothetical protein  62.02 
 
 		 129 aa  155  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00885978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000081  hypothetical protein  59.35 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281171  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05694  hypothetical protein  59.35 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0404  hypothetical protein  58.06 
 
 		 130 aa  153  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.455973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0259  hypothetical protein  57.69 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510441  normal  0.0378607 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4199  hypothetical protein  55.64 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3663  hypothetical protein  57.14 
 
 		 133 aa  147  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.281432  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0324  hypothetical protein  58.4 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3845  hypothetical protein  60 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.989826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4042  hypothetical protein  56.69 
 
 		 132 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3649  hypothetical protein  56.59 
 
 		 133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0295  hypothetical protein  56.59 
 
 		 133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4067  hypothetical protein  55.91 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4160  hypothetical protein  56.59 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.951952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0303  hypothetical protein  54.76 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0395  hypothetical protein  56 
 
 		 127 aa  140  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3965  hypothetical protein  57.48 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.529125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1958  hypothetical protein  46.34 
 
 		 133 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.140682  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3065  hypothetical protein  42.15 
 
 		 114 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286302  normal  0.0781246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3013  hypothetical protein  41.32 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0169522 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2982  hypothetical protein  41.32 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3170  hypothetical protein  41.32 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.740312 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3049  hypothetical protein  41.32 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997859 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2188  hypothetical protein  46.15 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.843382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1895  hypothetical protein  41.73 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.407598  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02547  hypothetical protein  42.48 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.950234  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3145  hypothetical protein  40.5 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0957  conserved hypothetical protein  42.48 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3020  hypothetical protein  42.48 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2869  hypothetical protein  42.48 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02582  hypothetical protein  42.48 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0980  hypothetical protein  42.48 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2858  hypothetical protein  42.48 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3209  hypothetical protein  40.71 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0573  hypothetical protein  40.74 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000392083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3984  hypothetical protein  39.67 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0801  hypothetical protein  38.53 
 
 		 113 aa  94.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2046  hypothetical protein  42.72 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00536411  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1421  hypothetical protein  41.58 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0950425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02270  hypothetical protein  39.82 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1046  hypothetical protein  41.49 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0219  hypothetical protein  36.89 
 
 		 101 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0218  hypothetical protein  35.92 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0209  hypothetical protein  35.92 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0274  hypothetical protein  41.57 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2307  hypothetical protein  34.65 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.58575e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0306  hypothetical protein  31.07 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3448  hypothetical protein  34.31 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0136  hypothetical protein  29.9 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0152  hypothetical protein  29.9 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000026617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0293  hypothetical protein  30.7 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000641316  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1084  hypothetical protein  30.69 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00346286  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3248  hypothetical protein  26.61 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0260  hypothetical protein  28.04 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3184  hypothetical protein  25.86 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000292442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>