33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0344 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0344  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0242  hypothetical protein  73.77 
 
 		 61 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3702  hypothetical protein  63.93 
 
 		 61 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0379  hypothetical protein  69.64 
 
 		 59 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0290  hypothetical protein  60.66 
 
 		 62 aa  84  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4198  hypothetical protein  60.66 
 
 		 61 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3999  hypothetical protein  60.66 
 
 		 61 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4109  hypothetical protein  60.66 
 
 		 61 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4080  hypothetical protein  60.66 
 
 		 61 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3694  hypothetical protein  59.02 
 
 		 61 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0251  hypothetical protein  59.02 
 
 		 61 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3890  hypothetical protein  59.02 
 
 		 61 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4261  hypothetical protein  72.55 
 
 		 53 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0217  hypothetical protein  63.64 
 
 		 57 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0439788 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0265  hypothetical protein  64.29 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.055242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3364  hypothetical protein  56.36 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2012  hypothetical protein  51.92 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000726923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3109  hypothetical protein  49.09 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2150  hypothetical protein  47.27 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0382415  normal  0.246071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1527  hypothetical protein  47.27 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.582526  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00506  hypothetical protein  42.31 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1887  hypothetical protein  43.64 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27500  hypothetical protein  46.3 
 
 		 73 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40740  hypothetical protein  44.64 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3454  hypothetical protein  44.64 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387369  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3321  hypothetical protein  41.82 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  0.853546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1981  hypothetical protein  41.82 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0680958  normal  0.093028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0476  hypothetical protein  46.15 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.660998  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2374  hypothetical protein  41.82 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1524  hypothetical protein  47.06 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000098396  normal  0.105023 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0554  hypothetical protein  46.51 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0222  putative transmembrane protein  38.6 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.701084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0241  hypothetical protein  36.84 
 
 		 70 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>