32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0251 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0251  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3694  hypothetical protein  100 
 
 
61 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3890  hypothetical protein  98.36 
 
 
61 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0290  hypothetical protein  91.8 
 
 
62 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4198  hypothetical protein  80 
 
 
61 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4080  hypothetical protein  80 
 
 
61 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4109  hypothetical protein  80 
 
 
61 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3999  hypothetical protein  80 
 
 
61 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3702  hypothetical protein  80 
 
 
61 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0379  hypothetical protein  71.93 
 
 
59 aa  90.9  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0242  hypothetical protein  63.93 
 
 
61 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0344  hypothetical protein  59.02 
 
 
61 aa  82  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4261  hypothetical protein  66.67 
 
 
53 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0285168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0217  hypothetical protein  61.4 
 
 
57 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0439788 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0265  hypothetical protein  68.42 
 
 
60 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.055242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3364  hypothetical protein  55.56 
 
 
60 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1527  hypothetical protein  46.43 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.582526  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2012  hypothetical protein  42.11 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000726923  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1524  hypothetical protein  43.86 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000098396  normal  0.105023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40740  hypothetical protein  52.78 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3109  hypothetical protein  41.82 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3454  hypothetical protein  52.78 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387369  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1981  hypothetical protein  43.14 
 
 
72 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0680958  normal  0.093028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3321  hypothetical protein  43.14 
 
 
71 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  0.853546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2374  hypothetical protein  43.14 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00506  hypothetical protein  32.2 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0476  hypothetical protein  38.89 
 
 
58 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.660998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0554  hypothetical protein  43.9 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2150  hypothetical protein  41.03 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0382415  normal  0.246071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0662  hypothetical protein  54.55 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1887  hypothetical protein  37.25 
 
 
72 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27500  hypothetical protein  40 
 
 
73 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>