29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0662 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0662  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  124  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3694  hypothetical protein  51.79 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0251  hypothetical protein  51.79 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0379  hypothetical protein  47.37 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3890  hypothetical protein  51.79 
 
 		 61 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3702  hypothetical protein  48.28 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0290  hypothetical protein  51.79 
 
 		 62 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00506  hypothetical protein  48.21 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4198  hypothetical protein  44.64 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0217  hypothetical protein  44.64 
 
 		 57 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0439788 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0476  hypothetical protein  43.1 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.660998  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3999  hypothetical protein  44.64 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0242  hypothetical protein  41.07 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4080  hypothetical protein  44.64 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4109  hypothetical protein  44.64 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0344  hypothetical protein  43.64 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1527  hypothetical protein  38.98 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.582526  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3364  hypothetical protein  39.66 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2012  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000726923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4261  hypothetical protein  44 
 
 		 53 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0265  hypothetical protein  53.85 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.055242  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3109  hypothetical protein  35.48 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1981  hypothetical protein  29.85 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0680958  normal  0.093028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3321  hypothetical protein  29.85 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  0.853546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1887  hypothetical protein  29.85 
 
 		 72 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2374  hypothetical protein  29.85 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1524  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000098396  normal  0.105023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2150  hypothetical protein  33.93 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0382415  normal  0.246071 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0554  hypothetical protein  38.78 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369006 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>