28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1981 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1981  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0680958  normal  0.093028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2374  hypothetical protein  98.57 
 
 		 80 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3321  hypothetical protein  98.57 
 
 		 71 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  0.853546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1887  hypothetical protein  92.96 
 
 		 72 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3109  hypothetical protein  73.91 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2150  hypothetical protein  63.24 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0382415  normal  0.246071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3454  hypothetical protein  68.12 
 
 		 75 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40740  hypothetical protein  66.67 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27500  hypothetical protein  62.86 
 
 		 73 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1524  hypothetical protein  45.45 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000098396  normal  0.105023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2012  hypothetical protein  38.57 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000726923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0476  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.660998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0554  hypothetical protein  61.36 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369006 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1527  hypothetical protein  45 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.582526  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0290  hypothetical protein  47.06 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0242  hypothetical protein  41.82 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4198  hypothetical protein  41.18 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0251  hypothetical protein  43.14 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3694  hypothetical protein  43.14 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4109  hypothetical protein  41.18 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4080  hypothetical protein  41.18 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3999  hypothetical protein  41.18 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3890  hypothetical protein  43.14 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3702  hypothetical protein  41.82 
 
 		 61 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0217  hypothetical protein  44.44 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0439788 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0344  hypothetical protein  41.82 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00506  hypothetical protein  41.51 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0265  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.055242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>