30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_27500 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_27500  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  144  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2150  hypothetical protein  74.29 
 
 		 75 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0382415  normal  0.246071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3109  hypothetical protein  64.79 
 
 		 72 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1887  hypothetical protein  62.86 
 
 		 72 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2374  hypothetical protein  61.11 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3321  hypothetical protein  61.11 
 
 		 71 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  0.853546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1981  hypothetical protein  62.86 
 
 		 72 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0680958  normal  0.093028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40740  hypothetical protein  57.75 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3454  hypothetical protein  56.34 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387369  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1524  hypothetical protein  41.18 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000098396  normal  0.105023 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0476  hypothetical protein  48.21 
 
 		 58 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.660998  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0344  hypothetical protein  46.3 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2012  hypothetical protein  41.38 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000726923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0242  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0217  hypothetical protein  46.3 
 
 		 57 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0439788 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0554  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369006 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4261  hypothetical protein  48 
 
 		 53 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1527  hypothetical protein  46.3 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.582526  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0222  putative transmembrane protein  31.88 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.701084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0241  hypothetical protein  30.43 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131422 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3364  hypothetical protein  45.45 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3702  hypothetical protein  41.67 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0290  hypothetical protein  40.38 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0264  hypothetical protein  31.94 
 
 		 75 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0317  transmembrane protein  27.03 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0366  hypothetical protein  30.43 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0265  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  41.2  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.055242  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0379  hypothetical protein  34.48 
 
 		 59 aa  40.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0251  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3694  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>