48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0241 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0241  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0222  putative transmembrane protein  95.71 
 
 		 70 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.701084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0366  hypothetical protein  90 
 
 		 70 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0317  transmembrane protein  62.86 
 
 		 74 aa  98.6  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0264  hypothetical protein  62.32 
 
 		 75 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3822  hypothetical protein  54.41 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.289947 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6173  hypothetical protein  65.08 
 
 		 66 aa  84.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2760  hypothetical protein  61.9 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2854  hypothetical protein  62.9 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.206103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2843  hypothetical protein  62.9 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.238867  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2229  hypothetical protein  62.9 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2899  hypothetical protein  61.9 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.869288  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0166  hypothetical protein  58.46 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1426  hypothetical protein  58.46 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3178  hypothetical protein  49.25 
 
 		 83 aa  80.1  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00832421  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0493  hypothetical protein  58.46 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0511  hypothetical protein  58.46 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2853  hypothetical protein  58.46 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0676  hypothetical protein  58.46 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3194  hypothetical protein  58.46 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0429  hypothetical protein  58.46 
 
 		 67 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4168  hypothetical protein  64.06 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.94904 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0460  hypothetical protein  58.21 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.23553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0548  hypothetical protein  59.38 
 
 		 69 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1937  putative transmembrane protein  55.74 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0759563  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1642  putative transmembrane protein  57.38 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.115403  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0186  hypothetical protein  47.76 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4388  hypothetical protein  47.62 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0280  hypothetical protein  67.57 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1248  hypothetical protein  42.37 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0329  hypothetical protein  62.86 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.209066  decreased coverage  0.00981736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1452  hypothetical protein  43.4 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.965141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1678  putative transmembrane protein  40.35 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2856  hypothetical protein  36.17 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.401347  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3533  hypothetical protein  36.17 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3904  putative transmembrane protein  41.46 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.150675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2815  hypothetical protein  41.27 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00688356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27500  hypothetical protein  30.43 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0881  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0526  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1467  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1436  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0627  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1242  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.871337  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4261  hypothetical protein  37.74 
 
 		 53 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0753  hypothetical protein  45.45 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129269  normal  0.0231659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0242  hypothetical protein  36.36 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0344  hypothetical protein  36.84 
 
 		 61 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>