26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00506 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00506  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  130  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0344  hypothetical protein  42.31 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3109  hypothetical protein  43.33 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1524  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000098396  normal  0.105023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2150  hypothetical protein  41.38 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0382415  normal  0.246071 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0242  hypothetical protein  35.85 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0379  hypothetical protein  37.04 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0251  hypothetical protein  32.2 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3694  hypothetical protein  32.2 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2374  hypothetical protein  41.51 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3321  hypothetical protein  41.51 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  0.853546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1981  hypothetical protein  41.51 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0680958  normal  0.093028 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0290  hypothetical protein  35.19 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3890  hypothetical protein  32.2 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0662  hypothetical protein  48.65 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3454  hypothetical protein  51.35 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1887  hypothetical protein  39.62 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3364  hypothetical protein  40.43 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4198  hypothetical protein  33.33 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3702  hypothetical protein  37.25 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40740  hypothetical protein  48.65 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4261  hypothetical protein  37.25 
 
 		 53 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0285168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4080  hypothetical protein  33.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4109  hypothetical protein  33.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.532613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3999  hypothetical protein  33.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1527  hypothetical protein  30.51 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.582526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>