56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1075 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1075  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  184  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1713  addiction module toxin, RelE/StbE family  61.36 
 
 
91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3574  addiction module toxin, RelE/StbE family  60 
 
 
90 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3186  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.33 
 
 
99 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11410  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.93 
 
 
93 aa  103  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0223  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.81 
 
 
92 aa  102  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.50496  normal  0.992926 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4998  addiction module antitoxin  52.22 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0505  hypothetical protein  47.73 
 
 
93 aa  92.8  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3886  hypothetical protein  48.31 
 
 
91 aa  83.6  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1376  addiction module toxin, RelE/StbE  45.56 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13187  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3824  hypothetical protein  46.07 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.617883  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0303  hypothetical protein  40.91 
 
 
93 aa  77  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.217401  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3395  addiction module antitoxin  43.18 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0253  hypothetical protein  43.18 
 
 
92 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0547  putative plasmid stabilisation system protein  43.48 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151138  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3382  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.05 
 
 
92 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0258  hypothetical protein  42.05 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00220  predicted toxin of the YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  42.05 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00224  hypothetical protein  42.05 
 
 
92 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0479  addiction module antitoxin  42.35 
 
 
90 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.233146  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3781  hypothetical protein  42.39 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3768  addiction module toxin, RelE/StbE family  41.38 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2035  hypothetical protein  40.22 
 
 
93 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0943  addiction module antitoxin  41.11 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015998  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2504  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.78 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1750  hypothetical protein  44.19 
 
 
106 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00200719  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3909  addiction module antitoxin  39.13 
 
 
93 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342792  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0970  hypothetical protein  42.22 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0001  addiction module antitoxin  46.97 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000155913  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17080  plasmid stabilization system protein/addiction module toxin  43.18 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5117  addiction module antitoxin  40.86 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313763  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1164  addiction module antitoxin  40.22 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4381  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.13 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1495  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.36 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3345  addiction module antitoxin  38.78 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110991  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1048  hypothetical protein  35.35 
 
 
101 aa  62.8  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000926705  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6454  plasmid stabilization system protein  38.04 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0121069  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2157  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.04 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541282  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2862  addiction module antitoxin  44.44 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806196  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4250  addiction module antitoxin  48.44 
 
 
101 aa  62  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0906167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2146  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.44 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4296  addiction module antitoxin  38.04 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000000263758  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0815  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.66 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0831  PZ12b  36.78 
 
 
88 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.262689  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1196  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.46 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0199  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.56 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.463195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4838  addiction module antitoxin  37.37 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1860  addiction module antitoxin  36.14 
 
 
91 aa  58.2  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.998901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4250  hypothetical protein  49.02 
 
 
55 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36930  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.78 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0963  hypothetical protein  49.02 
 
 
62 aa  52.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000747867  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1103  hypothetical protein  37.5 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0997  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.06 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0841  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.04 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.37027  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0508  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  31.03 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0213724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1311  plasmid stabilization system protein  31.58 
 
 
93 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.648885  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>