49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3824 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3824  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  191  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.617883  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3886  hypothetical protein  96.7 
 
 
91 aa  184  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3395  addiction module antitoxin  75.82 
 
 
92 aa  148  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0253  hypothetical protein  75.82 
 
 
92 aa  148  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3382  addiction module toxin, RelE/StbE family  74.73 
 
 
92 aa  147  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0258  hypothetical protein  74.73 
 
 
92 aa  147  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00220  predicted toxin of the YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  74.73 
 
 
92 aa  146  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00224  hypothetical protein  74.73 
 
 
92 aa  146  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4998  addiction module antitoxin  62.5 
 
 
90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0505  hypothetical protein  42.7 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1376  addiction module toxin, RelE/StbE  39.77 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13187  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1750  hypothetical protein  42.55 
 
 
106 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00200719  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1713  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.7 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0223  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.45 
 
 
92 aa  70.1  0.000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.50496  normal  0.992926 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11410  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.53 
 
 
93 aa  70.1  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3574  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.53 
 
 
90 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3768  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.33 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1075  hypothetical protein  46.07 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0970  hypothetical protein  39.29 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3186  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.2 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0199  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.93 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.463195 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2035  hypothetical protein  41.76 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5117  addiction module antitoxin  40.86 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313763  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2862  addiction module antitoxin  45.07 
 
 
79 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806196  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0547  putative plasmid stabilisation system protein  37.5 
 
 
89 aa  60.8  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151138  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0508  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  32.94 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0213724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3909  addiction module antitoxin  37.36 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342792  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3781  hypothetical protein  35.56 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4381  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.26 
 
 
93 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0479  addiction module antitoxin  36.56 
 
 
90 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.233146  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2157  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.87 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541282  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1048  hypothetical protein  40 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000926705  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0943  addiction module antitoxin  31.82 
 
 
91 aa  52.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015998  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4296  addiction module antitoxin  35.87 
 
 
93 aa  52  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000000263758  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2504  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.26 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6454  plasmid stabilization system protein  35.87 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0121069  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2146  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.1 
 
 
82 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4250  addiction module antitoxin  45.1 
 
 
101 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0906167 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0303  hypothetical protein  31.46 
 
 
93 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.217401  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3345  addiction module antitoxin  34.69 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110991  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1164  addiction module antitoxin  36.96 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1196  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.07 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17080  plasmid stabilization system protein/addiction module toxin  41.27 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0001  addiction module antitoxin  45.1 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000155913  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0815  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.78 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1495  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.87 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36930  addiction module toxin, RelE/StbE family  30 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4838  addiction module antitoxin  34.65 
 
 
111 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1860  addiction module antitoxin  28.41 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.998901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>