50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2504 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2504  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 
93 aa  187  5.999999999999999e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2035  hypothetical protein  62.37 
 
 
93 aa  120  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2157  addiction module toxin, RelE/StbE family  53.76 
 
 
93 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541282  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1164  addiction module antitoxin  52.69 
 
 
93 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6454  plasmid stabilization system protein  53.76 
 
 
93 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0121069  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4296  addiction module antitoxin  53.76 
 
 
93 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000000263758  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3909  addiction module antitoxin  50.54 
 
 
93 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342792  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3781  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5117  addiction module antitoxin  51.65 
 
 
93 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313763  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4381  addiction module toxin, RelE/StbE family  49.46 
 
 
93 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17080  plasmid stabilization system protein/addiction module toxin  56.96 
 
 
92 aa  90.5  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36930  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.37 
 
 
93 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0547  putative plasmid stabilisation system protein  41.76 
 
 
89 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3345  addiction module antitoxin  42 
 
 
100 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110991  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0970  hypothetical protein  50.55 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4250  addiction module antitoxin  56.45 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0906167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2146  addiction module toxin, RelE/StbE family  56.45 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0223  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.48 
 
 
92 aa  70.1  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.50496  normal  0.992926 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0943  addiction module antitoxin  38.04 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015998  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0505  hypothetical protein  43.82 
 
 
93 aa  64.3  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0001  addiction module antitoxin  48.44 
 
 
89 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000155913  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3886  hypothetical protein  38.46 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1075  hypothetical protein  48.15 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11410  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.08 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1495  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.33 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1376  addiction module toxin, RelE/StbE  36.26 
 
 
90 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13187  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1103  hypothetical protein  34.74 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0479  addiction module antitoxin  48.33 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.233146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3186  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.69 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4998  addiction module antitoxin  37.36 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3574  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.78 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0831  PZ12b  46.3 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.262689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1713  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.31 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3824  hypothetical protein  36.26 
 
 
91 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.617883  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3395  addiction module antitoxin  36.67 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0303  hypothetical protein  40.62 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.217401  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3768  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.07 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0253  hypothetical protein  36.67 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1196  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.87 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3382  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.56 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00224  hypothetical protein  35.56 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00220  predicted toxin of the YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  35.56 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0258  hypothetical protein  35.56 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1750  hypothetical protein  34.38 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00200719  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1860  addiction module antitoxin  29.35 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.998901  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4838  addiction module antitoxin  33.66 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0815  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.28 
 
 
101 aa  47  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0997  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.84 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0841  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.31 
 
 
106 aa  45.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.37027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2862  addiction module antitoxin  32.58 
 
 
79 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806196  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>