43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0997 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0997  addiction module toxin, RelE/StbE family  100 
 
 
107 aa  216  6e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0841  addiction module toxin, RelE/StbE family  63.55 
 
 
106 aa  119  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.37027  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0815  addiction module toxin, RelE/StbE family  53 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1196  addiction module toxin, RelE/StbE family  50 
 
 
102 aa  87  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0505  hypothetical protein  40.43 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3574  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.36 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1713  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.17 
 
 
91 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0223  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.78 
 
 
92 aa  60.5  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.50496  normal  0.992926 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1495  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.05 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0547  putative plasmid stabilisation system protein  38.95 
 
 
89 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151138  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1376  addiction module toxin, RelE/StbE  32.95 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13187  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0943  addiction module antitoxin  33.71 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015998  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0831  PZ12b  34.41 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.262689  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5117  addiction module antitoxin  30.77 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313763  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4296  addiction module antitoxin  30.23 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000000263758  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1103  hypothetical protein  36.08 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2157  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.23 
 
 
93 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541282  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11410  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.23 
 
 
93 aa  54.3  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0303  hypothetical protein  32.26 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.217401  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0001  addiction module antitoxin  45.83 
 
 
89 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000155913  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6454  plasmid stabilization system protein  29.07 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0121069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1075  hypothetical protein  47.06 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1164  addiction module antitoxin  34.83 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2146  addiction module toxin, RelE/StbE family  52.27 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4250  addiction module antitoxin  52.27 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0906167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3345  addiction module antitoxin  31.91 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110991  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0479  addiction module antitoxin  32.98 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.233146  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1860  addiction module antitoxin  32.18 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.998901  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0508  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  28.26 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0213724 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2035  hypothetical protein  31.76 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0970  hypothetical protein  33.73 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3768  addiction module toxin, RelE/StbE family  27 
 
 
106 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17080  plasmid stabilization system protein/addiction module toxin  46 
 
 
92 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3186  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.57 
 
 
99 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36930  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.26 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2504  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.21 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1750  hypothetical protein  28.74 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00200719  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3909  addiction module antitoxin  26.97 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342792  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4381  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.43 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3781  hypothetical protein  30.23 
 
 
93 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4998  addiction module antitoxin  30.53 
 
 
90 aa  42  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3886  hypothetical protein  28.92 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0394  hypothetical protein  39.47 
 
 
102 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000024452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>