40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0508 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0508  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  100 
 
 		 91 aa  186  7e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0213724 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0505  hypothetical protein  34.48 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4998  addiction module antitoxin  34.83 
 
 		 90 aa  63.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0199  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.78 
 
 		 93 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.463195 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3886  hypothetical protein  34.12 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1376  addiction module toxin, RelE/StbE  37.97 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3824  hypothetical protein  32.94 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.617883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0253  hypothetical protein  35.29 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3382  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.29 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3395  addiction module antitoxin  34.12 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0258  hypothetical protein  34.12 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3574  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.96 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00220  predicted toxin of the YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  32.94 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00224  hypothetical protein  32.94 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1713  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.1 
 
 		 91 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1048  hypothetical protein  31.91 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000926705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3768  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.26 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0001  addiction module antitoxin  40.98 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000155913  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11410  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.73 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3186  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.33 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1495  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.85 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1196  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.68 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0223  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.82 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.50496  normal  0.992926 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0815  addiction module toxin, RelE/StbE family  28.09 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0841  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.03 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.37027  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0997  addiction module toxin, RelE/StbE family  43.18 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2146  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.97 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4250  addiction module antitoxin  37.97 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0906167 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0831  PZ12b  42.55 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.262689  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0943  addiction module antitoxin  28.05 
 
 		 91 aa  43.5  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015998  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0970  hypothetical protein  37.78 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0547  putative plasmid stabilisation system protein  29.07 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151138  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1075  hypothetical protein  42.55 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2862  addiction module antitoxin  38.78 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2035  hypothetical protein  32.18 
 
 		 93 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6454  plasmid stabilization system protein  31.71 
 
 		 93 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0121069  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0479  addiction module antitoxin  31.82 
 
 		 90 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.233146  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5117  addiction module antitoxin  43.48 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1750  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00200719  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1860  addiction module antitoxin  27.71 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.998901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>