26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1048 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1048  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  204  3e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000926705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0199  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.26 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.463195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4998  addiction module antitoxin  37.37 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3886  hypothetical protein  41.33 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3395  addiction module antitoxin  41.89 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0253  hypothetical protein  41.89 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3382  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.54 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0505  hypothetical protein  36.36 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3186  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.74 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3824  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.617883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0258  hypothetical protein  40.54 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00224  hypothetical protein  40.54 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00220  predicted toxin of the YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  40.54 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0943  addiction module antitoxin  34.48 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1075  hypothetical protein  35.35 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11410  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.48 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3574  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.68 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0508  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  31.91 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0213724 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0223  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.18 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.50496  normal  0.992926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1713  addiction module toxin, RelE/StbE family  29.9 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1750  hypothetical protein  27 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00200719  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1376  addiction module toxin, RelE/StbE  28.28 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1103  hypothetical protein  33.66 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0303  hypothetical protein  28.28 
 
 		 93 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.217401  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0547  putative plasmid stabilisation system protein  30 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151138  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0831  PZ12b  31.96 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.262689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>