56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1376 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1376  addiction module toxin, RelE/StbE  100 
 
 		 90 aa  186  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11410  addiction module toxin, RelE/StbE family  51.16 
 
 		 93 aa  92  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3186  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.65 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1713  addiction module toxin, RelE/StbE family  50 
 
 		 91 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4998  addiction module antitoxin  50 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3574  addiction module toxin, RelE/StbE family  48.78 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3395  addiction module antitoxin  40.45 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0223  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.25 
 
 		 92 aa  79.7  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.50496  normal  0.992926 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3382  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.33 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0253  hypothetical protein  39.33 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3886  hypothetical protein  42.05 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0303  hypothetical protein  43.82 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.217401  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00220  predicted toxin of the YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  39.33 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00224  hypothetical protein  39.33 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0258  hypothetical protein  38.2 
 
 		 92 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1075  hypothetical protein  45.56 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0547  putative plasmid stabilisation system protein  40.45 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.151138  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3824  hypothetical protein  39.77 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.617883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1750  hypothetical protein  43.18 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00200719  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5117  addiction module antitoxin  41.94 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0505  hypothetical protein  40.7 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3768  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.08 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2035  hypothetical protein  42.39 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1495  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.54 
 
 		 98 aa  67  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0943  addiction module antitoxin  35.56 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015998  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3345  addiction module antitoxin  36.73 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110991  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1196  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.89 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0815  addiction module toxin, RelE/StbE family  38.89 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2157  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.56 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541282  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6454  plasmid stabilization system protein  39.56 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0121069  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2146  addiction module toxin, RelE/StbE family  50.82 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4296  addiction module antitoxin  39.56 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000000263758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4250  addiction module antitoxin  50.82 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0906167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3909  addiction module antitoxin  39.56 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342792  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3781  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1164  addiction module antitoxin  38.46 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1860  addiction module antitoxin  32.22 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.998901  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0508  toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family  37.97 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0213724 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0970  hypothetical protein  32.58 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000401968  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0841  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.96 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.37027  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2504  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.26 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4381  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.26 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0199  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.65 
 
 		 93 aa  57  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.463195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17080  plasmid stabilization system protein/addiction module toxin  45.31 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36930  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.16 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0001  addiction module antitoxin  37.04 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000155913  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0831  PZ12b  32.93 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.262689  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0479  addiction module antitoxin  34.12 
 
 		 90 aa  52  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.233146  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0997  addiction module toxin, RelE/StbE family  47.17 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2862  addiction module antitoxin  40.28 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4838  addiction module antitoxin  35.92 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4250  hypothetical protein  43.14 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1103  hypothetical protein  40.68 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0660  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.59 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1048  hypothetical protein  28.28 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000926705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1824  addiction module toxin, RelE/StbE family  37.33 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>