18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0986 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0986  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  471  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.628076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0820  hypothetical protein  44.16 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0304  hypothetical protein  35.5 
 
 
212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2111  hypothetical protein  35.2 
 
 
193 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0532  hypothetical protein  31.1 
 
 
208 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1103  hypothetical protein  31.5 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3621  hypothetical protein  35.21 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.537291  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1599  hypothetical protein  35.07 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.114098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0520  hypothetical protein  34.33 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.196458  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2057  hypothetical protein  28.57 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.61139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1053  hypothetical protein  31.9 
 
 
223 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2263  hypothetical protein  31.55 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2567  hypothetical protein  28.78 
 
 
250 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1847  hypothetical protein  33.33 
 
 
227 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1009  hypothetical protein  25.99 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2229  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.207384  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0798  hypothetical protein  28.57 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0809  hypothetical protein  28.57 
 
 
317 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.284049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>