17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1053 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1053  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  446  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2057  hypothetical protein  76.78 
 
 		 215 aa  333  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.61139  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2567  hypothetical protein  43.75 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2263  hypothetical protein  47.8 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1847  hypothetical protein  44.66 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2111  hypothetical protein  35.06 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0986  hypothetical protein  31.9 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.628076  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0532  hypothetical protein  32.76 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3621  hypothetical protein  35.56 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.537291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0304  hypothetical protein  30.13 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1103  hypothetical protein  31.21 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0820  hypothetical protein  33.08 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067101  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1599  hypothetical protein  31.52 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.114098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1009  hypothetical protein  28.68 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1407  hypothetical protein  41.3 
 
 		 77 aa  48.5  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0520  hypothetical protein  30.51 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.196458  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2229  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  42.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.207384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>