11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2229 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2229  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  169  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.207384  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1599  hypothetical protein  58.14 
 
 
213 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.114098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3621  hypothetical protein  48.84 
 
 
226 aa  50.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.537291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0532  hypothetical protein  55.26 
 
 
208 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0986  hypothetical protein  50 
 
 
231 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.628076  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1009  hypothetical protein  56.76 
 
 
214 aa  44.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1103  hypothetical protein  39.68 
 
 
205 aa  43.9  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148506  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1053  hypothetical protein  50 
 
 
223 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0520  hypothetical protein  30.3 
 
 
237 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.196458  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0820  hypothetical protein  56.67 
 
 
221 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067101  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2057  hypothetical protein  47.22 
 
 
215 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.61139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>