15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0532 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0532  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3621  hypothetical protein  41.87 
 
 
226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.537291  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1599  hypothetical protein  40.39 
 
 
213 aa  124  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.114098  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1009  hypothetical protein  32.39 
 
 
214 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0304  hypothetical protein  33.5 
 
 
212 aa  101  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0986  hypothetical protein  31.1 
 
 
231 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.628076  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1103  hypothetical protein  32.46 
 
 
205 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2111  hypothetical protein  37.7 
 
 
193 aa  99.8  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0820  hypothetical protein  34.92 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067101  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2263  hypothetical protein  34.76 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1053  hypothetical protein  32.69 
 
 
223 aa  62  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0520  hypothetical protein  27.91 
 
 
237 aa  55.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.196458  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2057  hypothetical protein  28.66 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.61139  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1847  hypothetical protein  29.92 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2229  hypothetical protein  55.26 
 
 
81 aa  47  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.207384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>