16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2263 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2263  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1847  hypothetical protein  45.66 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1053  hypothetical protein  49.04 
 
 		 223 aa  134  9e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2057  hypothetical protein  39.32 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.61139  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2567  hypothetical protein  36.67 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0532  hypothetical protein  34.76 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0986  hypothetical protein  31.55 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.628076  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1103  hypothetical protein  30.86 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3621  hypothetical protein  26.52 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.537291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0304  hypothetical protein  29.52 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1599  hypothetical protein  32.65 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.114098  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2111  hypothetical protein  26.9 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0520  hypothetical protein  29.63 
 
 		 237 aa  48.5  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.196458  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1407  hypothetical protein  42.55 
 
 		 77 aa  48.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0820  hypothetical protein  27.53 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067101  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1009  hypothetical protein  30.66 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>