16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1009 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1009  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  442  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0532  hypothetical protein  32.39 
 
 
208 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3621  hypothetical protein  30.37 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.537291  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1599  hypothetical protein  30.85 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.114098  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1103  hypothetical protein  29.87 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0304  hypothetical protein  29.56 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2111  hypothetical protein  27.75 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0520  hypothetical protein  30.87 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.196458  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1053  hypothetical protein  28.15 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2057  hypothetical protein  29.33 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.61139  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0820  hypothetical protein  29.69 
 
 
221 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067101  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0986  hypothetical protein  25.99 
 
 
231 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.628076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0587  hypothetical protein  51.11 
 
 
174 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1847  hypothetical protein  31.39 
 
 
227 aa  45.1  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2229  hypothetical protein  56.76 
 
 
81 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.207384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2263  hypothetical protein  30.66 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>