18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1599 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1599  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  435  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.114098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3621  hypothetical protein  40 
 
 
226 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.537291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0532  hypothetical protein  40.39 
 
 
208 aa  124  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2111  hypothetical protein  35.5 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0304  hypothetical protein  31.58 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1103  hypothetical protein  30.77 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0986  hypothetical protein  35.07 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.628076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0520  hypothetical protein  33.76 
 
 
237 aa  71.6  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.196458  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1009  hypothetical protein  30.85 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0820  hypothetical protein  32.52 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067101  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2229  hypothetical protein  58.14 
 
 
81 aa  58.5  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.207384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1847  hypothetical protein  33.86 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0798  hypothetical protein  28.79 
 
 
310 aa  53.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0809  hypothetical protein  28.79 
 
 
317 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.284049  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2263  hypothetical protein  32.65 
 
 
221 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1053  hypothetical protein  31.9 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2057  hypothetical protein  31.74 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.61139  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0055  hypothetical protein  32.58 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000504638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>