10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4154 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4154  major facilitator transporter  100 
 
 		 382 aa  723    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.570347  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6791  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3144  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4827  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.356192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0164  major facilitator transporter  28.4 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0167  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1937  major facilitator superfamily permease  26.23 
 
 		 385 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2604  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2394  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0750557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6313  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>