41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06860 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06860  lysophospholipase L1-like esterase  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.711369  normal  0.0507644 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  30.19 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.71 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  28.64 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  29.09 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  26.89 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  27.23 
 
 		 225 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  26.7 
 
 		 184 aa  52.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  28.23 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  28.99 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  31.1 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  26.64 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  31.71 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  30 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  26.64 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  30 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1815  acyl-CoA thioesterase I precursor  27.88 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  30.43 
 
 		 201 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  27.4 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  22.84 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  27.4 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  27.4 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  27.4 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  27.4 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  27.4 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  28.02 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5611  lipolytic protein G-D-S-L family  25.81 
 
 		 589 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0912  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.28 
 
 		 366 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.273013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  25.24 
 
 		 201 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1901  GDSL family lipase  25.11 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0627412 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  25 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1401  arylesterase  24.78 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3188  hypothetical protein  31.67 
 
 		 373 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  22.77 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3837  hypothetical protein  26.14 
 
 		 382 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  24.52 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  26.47 
 
 		 201 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  25.84 
 
 		 214 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0246  peptidoglycan-binding LysM  22.54 
 
 		 473 aa  42  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2271  GDSL family lipase  28.57 
 
 		 215 aa  42  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1603  lipolytic protein G-D-S-L family  28.57 
 
 		 215 aa  42  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>