More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1140 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1140  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
158 aa  317  5e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1429  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.6 
 
 
156 aa  191  4e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00186672  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1295  acetolactate synthase, small subunit  59.74 
 
 
156 aa  189  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0678  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.95 
 
 
154 aa  181  3e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0603  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.95 
 
 
154 aa  181  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0139  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.63 
 
 
155 aa  180  6e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.70464  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1166  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  54.55 
 
 
156 aa  180  8.000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1095  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  56.29 
 
 
154 aa  179  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00406185  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0817  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  55.63 
 
 
153 aa  178  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0812  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.66 
 
 
155 aa  167  6e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.61 
 
 
168 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  42.04 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.29 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  38.71 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.65 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.65 
 
 
163 aa  114  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.03 
 
 
162 aa  114  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.65 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.35 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0154  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.65 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2167  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.998104  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2434  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.65 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312888  normal  0.272193 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1904  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.52 
 
 
163 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.77 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
163 aa  110  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0635  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  36.77 
 
 
172 aa  109  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3400  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.31 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2931  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.31 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3530  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.31 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1878  acetolactate synthase, small subunit  40.13 
 
 
177 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0996051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.06 
 
 
182 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.71 
 
 
175 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2556  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.11 
 
 
165 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.080772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.31 
 
 
163 aa  108  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  36.54 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0883  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.71 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0737902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2144  acetolactate synthase, small subunit  38.71 
 
 
170 aa  107  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0207979  normal  0.0119261 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
163 aa  107  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2557  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
163 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0881819  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3604  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.67 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.06 
 
 
172 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.46 
 
 
164 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  37.91 
 
 
161 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  38.46 
 
 
170 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3792  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.03 
 
 
163 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  36.71 
 
 
163 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.82 
 
 
164 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1591  acetolactate synthase, small subunit  36.54 
 
 
166 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0635  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.38 
 
 
163 aa  105  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33731  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2465  acetolactate synthase, small subunit  38.22 
 
 
170 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.463882  normal  0.328316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1977  acetolactate synthase, small subunit  38.12 
 
 
178 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1901  acetolactate synthase, small subunit  38.12 
 
 
178 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518897  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0523  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
165 aa  104  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.612451  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1986  acetolactate synthase, small subunit  38.12 
 
 
178 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0072  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.68 
 
 
163 aa  104  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1780  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.65 
 
 
171 aa  104  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0230  acetolactate synthase, small subunit  38.46 
 
 
187 aa  104  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.09057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  37.25 
 
 
167 aa  104  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0084  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.68 
 
 
173 aa  103  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.71 
 
 
163 aa  104  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00080  acetolactate synthase small subunit  42.68 
 
 
163 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3521  acetolactate synthase, small subunit  42.68 
 
 
163 aa  103  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
167 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00079  hypothetical protein  42.68 
 
 
163 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0080  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.68 
 
 
163 aa  103  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.06 
 
 
163 aa  103  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3579  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.68 
 
 
163 aa  103  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0084  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.68 
 
 
163 aa  103  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
167 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  37.91 
 
 
167 aa  103  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0625  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.04 
 
 
163 aa  103  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2369  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.38 
 
 
163 aa  103  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0528  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
165 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.973022 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.49 
 
 
161 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1903  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.19 
 
 
159 aa  103  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0129  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.04 
 
 
164 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.942992  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2774  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.35 
 
 
163 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.805541  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.04 
 
 
164 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0126  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.04 
 
 
164 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0128  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.04 
 
 
164 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.480792  hitchhiker  0.000114859 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.04 
 
 
169 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0610  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.03 
 
 
164 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.948647 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0746  acetolactate synthase, small subunit  36.13 
 
 
161 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0597  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.74 
 
 
163 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.539091  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0893  acetolactate synthase, small subunit  36.13 
 
 
163 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.254483  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  40.51 
 
 
166 aa  102  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1691  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.06 
 
 
162 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.74 
 
 
164 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.343992  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5324  acetolactate synthase, small subunit  38.85 
 
 
180 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0610  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.65 
 
 
171 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118044  normal  0.926939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0948  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.71 
 
 
163 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0671  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.42 
 
 
176 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0328623  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0912  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.06 
 
 
163 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13311  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.06 
 
 
174 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477847  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13461  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.06 
 
 
174 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  37.42 
 
 
165 aa  101  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0087  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.04 
 
 
173 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>