More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0812 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0812  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  100 
 
 
155 aa  310  6.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0678  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  74.51 
 
 
154 aa  244  4e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0603  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  74.51 
 
 
154 aa  244  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1095  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  73.86 
 
 
154 aa  241  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00406185  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0817  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  73.03 
 
 
153 aa  239  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1429  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  71.05 
 
 
156 aa  235  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00186672  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0139  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  67.11 
 
 
155 aa  223  9e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.70464  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1295  acetolactate synthase, small subunit  65.79 
 
 
156 aa  209  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1166  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.53 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1140  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  51.66 
 
 
158 aa  167  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.94 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0635  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.33 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.33731  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3530  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.51 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2931  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.51 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3400  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.51 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.08 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.306169  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1829  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.08 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  43.14 
 
 
167 aa  114  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2270  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.08 
 
 
164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493078  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2278  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.67 
 
 
164 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1781  acetolactate synthase, small subunit  41.33 
 
 
164 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0752076 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.14 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2667  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  46.05 
 
 
164 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000176129  decreased coverage  0.000698491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1775  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.74 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0883  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.61 
 
 
163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0737902  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2271  acetolactate synthase, small subunit  42.67 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.38 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2123  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.343992  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0597  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.76 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.539091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1972  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.46 
 
 
164 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0607984  hitchhiker  0.0000404141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2387  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.46 
 
 
164 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2491  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.46 
 
 
164 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126247  hitchhiker  0.000727987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2375  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  61.46 
 
 
164 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0991612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.05 
 
 
163 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.512898  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  42.11 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1878  acetolactate synthase, small subunit  40.4 
 
 
177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0996051 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0072  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.42 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0129  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.86 
 
 
164 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.942992  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0126  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.86 
 
 
164 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0128  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.86 
 
 
164 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.480792  hitchhiker  0.000114859 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.86 
 
 
164 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2139  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  59.38 
 
 
164 aa  110  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.141993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0084  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.42 
 
 
173 aa  110  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0749  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.86 
 
 
163 aa  110  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0133  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.86 
 
 
169 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.103905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00080  acetolactate synthase small subunit  43.42 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3521  acetolactate synthase, small subunit  43.42 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3579  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.42 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00079  hypothetical protein  43.42 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0084  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.42 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0080  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.42 
 
 
163 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2157  acetolactate synthase, small subunit  38.26 
 
 
163 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1954  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  45.1 
 
 
164 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0934233 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3604  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.76 
 
 
163 aa  110  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.95 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3792  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.76 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3237  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.761628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.6 
 
 
163 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000667629  hitchhiker  0.0000555489 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0625  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.11 
 
 
163 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2019  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44 
 
 
164 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128941  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1261  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.06 
 
 
163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.105007  hitchhiker  0.000000415778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2038  acetolactate synthase, small subunit  39.61 
 
 
166 aa  107  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.153751  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1627  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.33 
 
 
164 aa  107  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.800745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0087  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.76 
 
 
173 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4866  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.13 
 
 
163 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2369  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.74 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.38 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1496  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  58.95 
 
 
163 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.440871 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1275  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1847  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1114  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1420  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  38.56 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0473  acetolactate synthase, small subunit  39.33 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.990351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1046  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0397  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0752  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  60.44 
 
 
163 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2832  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.14 
 
 
164 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1780  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.33 
 
 
171 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5591  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
163 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68228 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1770  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.07 
 
 
163 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488316  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2180  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
163 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177341  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1952  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.07 
 
 
163 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.56 
 
 
162 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2302  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
163 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353704  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3111  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.82 
 
 
163 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00654911  normal  0.734672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2243  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.22 
 
 
180 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.219728  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1014  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
163 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2287  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
163 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.766326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3323  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.07 
 
 
163 aa  104  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2419  acetolactate synthase, small subunit  43.24 
 
 
184 aa  105  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2318  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.07 
 
 
163 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342254  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1653  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
163 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2264  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.67 
 
 
163 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.855191  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0230  acetolactate synthase, small subunit  40.88 
 
 
187 aa  104  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  8.09057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001648  acetolactate synthase small subunit  42.76 
 
 
164 aa  104  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00890505  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00826  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.76 
 
 
164 aa  103  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>