23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2685 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2685  AroM family protein  100 
 
 
227 aa  458  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.864321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0212  hypothetical protein  42.34 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1827  hypothetical protein  41.82 
 
 
223 aa  165  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.988892  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1025  hypothetical protein  36.44 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4170  AroM family protein  37.05 
 
 
239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000209007  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0256  hypothetical protein  38.68 
 
 
226 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1686  AroM family protein  33.33 
 
 
235 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0341417  normal  0.432359 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0464  hypothetical protein  26.34 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0428  hypothetical protein  27.23 
 
 
225 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.855339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0427  hypothetical protein  27.23 
 
 
225 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0433  hypothetical protein  27.23 
 
 
225 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0488  hypothetical protein  27.23 
 
 
225 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0446  hypothetical protein  27.23 
 
 
225 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.278039  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0420  hypothetical protein  25.89 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0307  hypothetical protein  25.45 
 
 
225 aa  91.7  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0417  hypothetical protein  25.45 
 
 
225 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0458  hypothetical protein  25.45 
 
 
225 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3218  AroM family protein  25.45 
 
 
225 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1854  LuxR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
310 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00337  hypothetical protein  25.45 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3242  hypothetical protein  25.45 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32853  normal  0.0411186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00341  hypothetical protein  25.45 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0861  hypothetical protein  26.79 
 
 
225 aa  88.6  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.37011  normal  0.40333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>