23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1827 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1827  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  436  1e-121  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.988892  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0212  hypothetical protein  40 
 
 
223 aa  175  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2685  AroM family protein  41.82 
 
 
227 aa  165  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.864321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4170  AroM family protein  27.39 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000209007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1686  AroM family protein  29.46 
 
 
235 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0341417  normal  0.432359 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0256  hypothetical protein  27.83 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1025  hypothetical protein  29.55 
 
 
225 aa  95.1  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1854  LuxR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00341  hypothetical protein  24.44 
 
 
225 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3242  hypothetical protein  24.44 
 
 
225 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32853  normal  0.0411186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00337  hypothetical protein  24.44 
 
 
225 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0307  hypothetical protein  24.44 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0420  hypothetical protein  24.44 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0417  hypothetical protein  24.44 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0458  hypothetical protein  24.44 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3218  AroM family protein  24.44 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0464  hypothetical protein  24.44 
 
 
225 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0861  hypothetical protein  22.77 
 
 
225 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.37011  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0433  hypothetical protein  22.41 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0488  hypothetical protein  22.41 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0446  hypothetical protein  22.41 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.278039  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0427  hypothetical protein  22.41 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0428  hypothetical protein  22.41 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.855339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>