23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0428 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0428  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.855339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0427  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0446  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.278039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0488  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0433  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0420  hypothetical protein  78.22 
 
 		 225 aa  362  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0464  hypothetical protein  78.22 
 
 		 225 aa  361  6e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3218  AroM family protein  77.78 
 
 		 225 aa  359  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00341  hypothetical protein  77.78 
 
 		 225 aa  359  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0307  hypothetical protein  77.78 
 
 		 225 aa  359  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3242  hypothetical protein  77.78 
 
 		 225 aa  359  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32853  normal  0.0411186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0417  hypothetical protein  77.78 
 
 		 225 aa  359  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0458  hypothetical protein  77.78 
 
 		 225 aa  359  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00337  hypothetical protein  77.78 
 
 		 225 aa  359  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0861  hypothetical protein  73.21 
 
 		 225 aa  332  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.37011  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1025  hypothetical protein  40.62 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0256  hypothetical protein  32.38 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2685  AroM family protein  27.23 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.864321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0212  hypothetical protein  26.22 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4170  AroM family protein  28.95 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000209007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1686  AroM family protein  27.11 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0341417  normal  0.432359 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1827  hypothetical protein  22.41 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.988892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1854  LuxR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>