22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3242 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_00341  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3242  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32853  normal  0.0411186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00337  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3218  AroM family protein  99.11 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0458  hypothetical protein  99.11 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0417  hypothetical protein  99.11 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0307  hypothetical protein  99.11 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0464  hypothetical protein  97.33 
 
 		 225 aa  437  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0420  hypothetical protein  97.33 
 
 		 225 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0433  hypothetical protein  77.78 
 
 		 225 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0428  hypothetical protein  77.78 
 
 		 225 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.855339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0427  hypothetical protein  77.78 
 
 		 225 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0446  hypothetical protein  77.78 
 
 		 225 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.278039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0488  hypothetical protein  77.78 
 
 		 225 aa  359  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0861  hypothetical protein  69.2 
 
 		 225 aa  319  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.37011  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1025  hypothetical protein  41.07 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0256  hypothetical protein  34.29 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2685  AroM family protein  25.45 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.864321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4170  AroM family protein  27.19 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000209007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0212  hypothetical protein  25.33 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1827  hypothetical protein  24.44 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.988892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1686  AroM family protein  24.89 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0341417  normal  0.432359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>